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《生物分离技术》共分九个单元：第一单元介绍了生物分离技术的特点、一般工艺过程和方法选择原则；从第二单元开始到第八单元分别介绍了原料的预处理技术、萃取技术、固相析出分离技术、吸附与离子交换技术、膜分离技术、色谱分离技术和浓缩干燥技术等常用的生物分离与纯化技术；第九单元是实验实训，共安排了15项操作性强、实验效果好的分离与纯化实验，以利于学生巩固基本理论知识，更接近将来的就业岗位实际情况。
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